(1)質(zhì)粒DNA的質(zhì)量和濃度: 用于轉化的質(zhì)粒DNA應主要是超螺旋態(tài)的,轉化率與外源DNA的濃度在一定范圍內成正比,但當加入的外源DNA的量過(guò)多或體積過(guò)大時(shí),則會(huì )使轉化率下降。
一般地,DNA溶液的體積不應超過(guò)感受態(tài)細胞體積的5%,1ng的cccDNA即可使50ul的感受態(tài)細胞達到飽和。對于以質(zhì)粒為載體的重組分子而言,分子量大的轉化效率低,實(shí)驗證明,大于30kb的重組質(zhì)粒將很難進(jìn)行轉化。
此外,重組DNA分子的構型與轉化效率也密切相關(guān),環(huán)狀重組質(zhì)粒的轉化率較分子量相同的線(xiàn)性重組質(zhì)粒高10~100倍,因此重組DNA大都構成環(huán)狀雙螺旋分子。 (2)感受態(tài)細胞的質(zhì)量: 所用的CaCl2等試劑均需是最高純度的,并用最純凈的水配制,最好分裝保存于4℃ (3)細胞的生長(cháng)狀態(tài)和密度 最好從-70℃或-20℃甘油保存的菌種中直接轉接用于制備感受態(tài)細胞的菌液。
不要用已經(jīng)過(guò)多次轉接,及貯存在4℃的培養菌液。細胞生長(cháng)密度以每毫升培養液中的細胞數在5*107個(gè)左右為佳。
即應用對數期或對數生長(cháng)前期的細菌,可通過(guò)測定培養液的OD600控制。對TG1菌株,OD600為0.5時(shí),細胞密度在5*107個(gè)/ml左右。
(應注意OD600值與細胞數之間的關(guān)系隨菌株的不同而不同)。密度過(guò)高或不足均會(huì )使轉化率下降。
(二)感受態(tài)細胞轉化中的影響: 整個(gè)操作過(guò)程均應在無(wú)菌條件下進(jìn)行,所用器皿,如離心管,移液槍頭等最好是新的,并經(jīng)高壓滅菌處理。所有的試劑都要滅菌,且注意防止被其它試劑、DNA酶或雜DNA所污染,否則均會(huì )影響轉化效率或雜DNA的轉入。
整個(gè)操作均需在冰上進(jìn)行,不能離開(kāi)冰浴,否則細胞轉化率將會(huì )降低。
方法一:細菌轉化的方法多以Mendel和Higa(1970)的發(fā)現為基礎,其基本方法是用冰預冷的CaCl2或多種2價(jià)陽(yáng)離子等處理細菌,使之進(jìn)入感受態(tài)得以轉化。
用CaCl2制備新鮮或冷凍的大腸桿菌感受態(tài)細胞,常用于成批制備感受態(tài)細菌。本法適用于大多數大腸桿菌菌株,且迅速、重復性好。
操作過(guò)程簡(jiǎn)述如下。1.從37℃培養16~20h的新鮮平板中挑取一個(gè)單菌落(如大腸桿菌DH52),或1ml新鮮的16~20h過(guò)夜培養物,轉到一個(gè)含有100mlLB培養基的1L或500ml燒瓶中。
于37℃劇烈振搖培養約2~3h(旋轉搖床200~300r/min),每隔20~30min測量OD600值≈0.4。2.在無(wú)菌條件下將細菌轉移到一個(gè),用冰預冷的50ml聚丙烯離心管中,在冰上放置10~20min。
3.于4℃用SorvallGS2轉頭(或與其離心管相配的轉頭)以4000r/min離心10min,以回收細胞。4.倒數培養液,將管倒置1min以使最后殘留的痕量培養液流盡。
5.以10ml用冰預冷的0.1mMCaCl2重懸每份沉淀,放于冰上。6.于4℃用SorvallGS3轉頭(或與其相應的轉頭)以4000r/min離心10min,以回收細胞。
7.倒出培養液,將管倒置1min以使最后殘留的痕量培養液流盡。8.每50ml初始培養物用2ml冰預冷的0.1MCaCl2重懸每份沉定,此時(shí),可以迅速將細胞分裝成小份,液氮中冰凍,-70℃貯存備用。
9.用冷卻的無(wú)菌吸頭從每種感受態(tài)細胞懸液中各取200μl轉移到無(wú)菌的微量離心管中,每管加DNA或連接反應混合物(體積≤10μl,DNA≤50ng),輕輕旋轉以混勻內容物,在冰中放置30min。10.將離心管放到預加溫到40℃的循環(huán)水浴中的試管架上,放置90s~2min,不要搖動(dòng)試管。
11.快速將管轉移到冰浴中,使細胞冷卻1~2min。12.每離心管加800μlSOC培養基,用水浴將培養基加溫到37℃,然后將管轉移到37℃搖床上,溫育45min使細菌復蘇,并且表達質(zhì)粒編碼的抗生素抗性標記基因。
13.將適當體積(每個(gè)90mm平板可達200μl)已轉化的感受態(tài)細胞轉移到含200mmol/lMgSO4和相應抗生素的SOB培養基上。14.將平板置于室溫至液體被吸收。
15.倒置平皿,于37℃培養,12~16h后可出現菌落。方法二:CASsuperOne-采用一種簡(jiǎn)單便捷的方法處理大腸桿菌,使其成為感受態(tài)細胞,便于質(zhì)粒DNA的轉化,可滿(mǎn)足一般實(shí)驗的要求。
與CaCl2法相比具有多種優(yōu)點(diǎn):使用方便,只需一步即可完成感受態(tài)細胞的制備;轉化效率略高于CaCl2法,一般可達106-108cfu/μg,滿(mǎn)足一般實(shí)驗需要;感受態(tài)細胞制成后即可保存于-70℃,無(wú)須加入甘油,并且經(jīng)長(cháng)期保存活力無(wú)明顯下降。準備工作:1.從液氮或低溫冰箱中取出的大腸桿菌凍存菌,在LB平板上劃線(xiàn),37度過(guò)夜至長(cháng)出單菌落。
挑形態(tài)飽滿(mǎn)的單菌落2個(gè),分別接種5mlLB培養基中,37℃,250rpm,過(guò)夜培養。2.次日從5mlLB培養物吸取200μl轉入50mlLB培養基中(250ml錐形瓶),37℃,250rpm培養2小時(shí),此時(shí)OD600約0.4—0.5。
感受態(tài)細胞的制備:3.吸取1ml菌液到1.5ml離心管里,5000rpm離心5分鐘,棄去上清。4.加入100μl預冷的SolutionA,懸浮菌體,冰浴30分鐘。
5.此時(shí)感受態(tài)細胞已經(jīng)制成可立即使用或-70℃保存。細胞轉化:6.在感受態(tài)細胞中加入100pg-10ngDNA,混勻,冰浴30分鐘,然后42℃1分鐘熱擊,再次冰浴2分鐘。
加入0.9mlLB培養基,20μlSolutionB,37℃,振蕩培養1小時(shí)。7.取適當菌液(100-200μl)涂布相應抗性的平板。
8.過(guò)夜培養約16個(gè)小時(shí),數菌落數,計算轉化率。補充說(shuō)明:1.所用器具一定要清潔;2.操作步驟2中培養基的裝量也是很重要的,建議裝量不要高于此值:500ml錐形瓶裝100ml培養基,250ml錐形瓶裝50ml培養基;3.在收獲菌體前半小時(shí)還可以在培養基中加入20mM的MgCl2,效果會(huì )更好一些;4.為保證細胞處于對數生長(cháng)期,培養后的菌體的OD值不要高于0.6;5.制備感受態(tài)細胞時(shí)所有操作盡量保證在冰上操作;6.細胞轉化操作步驟6中也可以不必進(jìn)行熱擊,冰浴后直接加入新鮮LB,簡(jiǎn)化操作步驟,但轉化效率低于熱擊方法,適用于對轉化率要求不高的實(shí)驗。
方法三:1、取1%大腸桿菌E.coli接種于含2mlLB培養基的試管中,37℃振蕩培養過(guò)夜2、取0.1ml過(guò)夜培養物轉種于含10mlLB培養基的三角瓶中,37℃振蕩培養3h至OD600=0.3ml離心管中,冰浴10min。4、在4℃下以4000rpm離心5min,去上清液5、把菌體懸浮于15m1冰冷的0.1MCaCl2溶液中,置冰上30min6、然后再在4℃下以4000rpm離心10min,去上清液7、將菌體懸浮于0.1mlCaCl2溶液中,冰浴放置4-12hr備用。
方法四:(1)將1ml過(guò)夜培養的細菌(如DH52、TG1、TM101)接種于100ml2*YT培養于500ml燒瓶。于37℃刷烈振蕩,通常≥200rpm培養的細菌密度約OD550=0.2~0.5(5*107cells/ml),需2~4h。
(2)將培養物放于冰上致冷10min,于4℃離心細菌培養物,10000rpm離心10min。(3)棄除上清,將細菌懸浮于原始培養體積的一半(約50ml)的50mMCaCl2和10mmTris·HCl(pH8.0)無(wú)菌冷凍液體中。
(4)將細菌懸浮放在冰上約5min,然后將懸浮物于4℃10000/rpm離心10min。(5)棄上清,懸浮細菌于原始培養體積的1/15的50mMCaCl和10mMTris·HCl(pH8.0)無(wú)菌冷凍中。
此時(shí)的細。
1、種子接種:將凍干管或甘油管種子接種到LB培養基搖瓶中進(jìn)行活化,一般可以加抗性標記對應的抗生素。然后搖床恒溫培養。
2、發(fā)酵培養基準備:搖瓶的話(huà)好說(shuō),滅菌鍋就行。發(fā)酵罐的話(huà),要先將罐子清洗干凈,然后配料,然后滅菌。
3、將培養好的種子液,按一定的接種量接到發(fā)酵培養基中。如果是搖瓶發(fā)酵的話(huà)一般不用中控,時(shí)間到了放瓶即可。如果是發(fā)酵罐發(fā)酵的話(huà),中間過(guò)程需要補料、調節PH值、控制好溶氧轉速等等。要注意取樣時(shí)樣液的密封性,如果樣液到處亂撒,容易導致噬菌體污染。
4、不論是產(chǎn)酶、蛋白、氨基酸還是別的什么,產(chǎn)物量都是必須檢測的哦。
5、放罐后,也要注意料液的收集、使用和滅活,嚴防噬菌體污染。
復蘇:
配制LB固體培養基,高壓蒸汽滅菌,倒平板。
挑取菌種,在培養基上劃線(xiàn)。
37℃培養24h至長(cháng)出菌落。
搖菌
配制LB液體培養基。高壓蒸汽滅菌。
無(wú)菌試管內加入3ml LB培養基,挑取單菌落加入培養基中,37℃,200rpm搖菌過(guò)夜。
擴大培養:
配制LB液體培養基。高壓蒸汽滅菌。
三角瓶中加入50ml液體LB培養基,加入1ml菌液,37℃,200rpm搖菌至所需OD值。
注:培養基內需加入菌株所具有抗性的抗生素。
工具:超凈工作臺、酒精燈、接種針、試管、高壓滅菌鍋、培養皿等。
注意無(wú)菌操作。
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