紫外吸收檢測DNA濃度與純度2007年11月13日 星期二 11:40目的: 了解紫外吸收檢測DNA濃度與純度的原理,掌握測定方法。
原理: 核酸的最大吸收波長(cháng)為260nm,蛋白質(zhì)為280nm,在波長(cháng)260nm時(shí),1OD值相當于雙鏈DNA濃度為50μg/ml,單鏈 寡核苷酸的含量為30μg/ml,可以據此來(lái)計算核酸樣品的濃度,還可通過(guò)測定在260nm和280nm的OD值的比值 (OD260/OD280),估計核酸的純度。純凈DNA的比值為1.8, RNA為2.0。
若比值高于1.8說(shuō)明DNA樣品中的RNA尚未除 盡,若樣品中含有酚和蛋白質(zhì)將導致比值降低。270nm存在高吸收表明有酚的干擾。
紫外分光光度法只能用于測定濃度 大于0.25μg/ml的核酸溶液,對濃度更小的樣品,可采用熒光分光光度法。 試劑與儀器: 提取的質(zhì)粒DNA,紫外分光光度儀。
操作步驟: 1) 分光光度計先用水在260nm和280nm兩個(gè)波長(cháng)下校零。 2) 取質(zhì)粒DNA樣品2μl,用水稀釋100倍,轉入分光光度計的石英比色杯中。
3) 在260nm和280nm分別讀出樣品光密度值。如果樣品濃度單位為μg/μl,則樣品DNA濃度為OD 值的10倍,即如 OD260=0.1,則樣品濃度即為1μg/μl。
4) 若OD260/OD280大于1.8,說(shuō)明仍有RNA,可以考慮用RNA酶處理樣品,若小于1.8,說(shuō) 明樣品中含有蛋白質(zhì)或酚,應再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀純化DNA。
方法的驗證: 訂入質(zhì)量標準的含量測定法不同于一般質(zhì)量考察的方法,須經(jīng)過(guò)嚴格的方法學(xué)驗證,不同原理的測定法具有不同的驗證內容及要求:
(1)容量分析法的驗證:①精密度:用原料藥精制品考察方法精密度,平行試驗5個(gè)樣本的RSD≤0.2%;②準確度:以測定原料精制品(含量>99.5%)的回收率(測定值與理論值的比值)計算,應在99.7%~100.3%之間(n=5,RSD≤0.1%);③滴定終點(diǎn)確定的依據:包括滴定曲線(xiàn)的繪制,如用指示劑法確定終點(diǎn),應用電位法校準終點(diǎn)顏色,提供指示劑顏色與電位變化情況的對比結果;④耐用性:考察測定條件(供試液穩定性、樣品提取次數、時(shí)間等)有微小變動(dòng)時(shí),測定結果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時(shí)則應在方法中注明。
(2)HPLC法的驗證:①精密度:RSD≤2%(n=5);②準確度:用于制劑時(shí),要考察輔料的影響,將一定量藥物加到按處方比例配制的輔料中(為標示量的80%~120%)制成高、中、低三個(gè)劑量,混合均勻后,每個(gè)劑量取三份樣品,按擬定方法測定回收率,應在98%~102%之間(n=9, RSD≤2%)。③線(xiàn)性范圍:用已知含量的精制品配制一系列濃度的溶液(n=5~7),用濃度C對峰面積A或峰高h或被測物的響應值之比進(jìn)行回歸處理,線(xiàn)性方程的相關(guān)系數r≥0.999,截距應趨于零,并提供線(xiàn)性關(guān)系圖;④專(zhuān)屬性:輔料、有關(guān)物質(zhì)或降解產(chǎn)物峰對主藥峰應無(wú)干擾;⑤耐用性:考察測定條件(供試液穩定性、流動(dòng)相組成和pH值、不同品牌或批號的同類(lèi)色譜柱、柱溫、流速、樣品提取次數、時(shí)間等)有微小變動(dòng)時(shí),測定結果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時(shí)則應在方法中注明;⑥靈敏度:作為常量分析法,此項可不作主要要求。
(3)UV法的驗證:①精密度:RSD≤1%(n=5);②準確度:方法同HPLC法,回收率應在98%~102%之間(n=9, RSD≤2%),同時(shí)要求輔料、有關(guān)物質(zhì)或降解產(chǎn)物在測定波長(cháng)處無(wú)吸收。③線(xiàn)性范圍:用已知含量的精制品配制一系列濃度的溶液(n=5~7,吸收度A在0.2~0.7間),用濃度C對峰面積A或峰高h或被測物的響應值之比進(jìn)行回歸處理,線(xiàn)性方程的相關(guān)系數r應≥0.999,截距應趨于零,并提供線(xiàn)性關(guān)系圖;④耐用性:考察測定條件(供試液穩定性、樣品提取次數、時(shí)間、比色法中顯色劑用量、反應溫度、時(shí)間、pH值等)有微小變動(dòng)時(shí),測定結果不受影響的承受程度,如測試條件要求苛刻時(shí)則應在方法中注明;⑤靈敏度:作為常量分析法,此項可不作主要要求。
吸收度A在0.2~0.8間其線(xiàn)形關(guān)系好,利用標準品建立標準曲線(xiàn)后,受測溶液做適當的稀釋?zhuān)蛊湮斩仍?.2~0.8,如果太小或太大,都將影響測定的準確性的。
化合物純度的鑒定方法
一 通過(guò)TLC的純度的鑒定 1 展開(kāi)溶劑的選擇,不只是至少需要3種不同極性展開(kāi)系統展開(kāi),通常是首先要選擇三種分子間作用力不同的溶劑系統,如氯仿\甲醇,環(huán)己烷\乙酸乙酯,正丁醇\醋酸\水,分別展開(kāi)來(lái)確定組分是否為單一斑點(diǎn)。這樣做的好處是很明顯的,通過(guò)組份間的各種差別將組分分開(kāi),有可能幾個(gè)相似組份在一種溶劑系統中是單一斑點(diǎn),因為該溶劑系統與這幾個(gè)組分的分子間力作用無(wú)顯著(zhù)的差別,不足以在TLC區分。而換了分子間作用力不同的另一溶劑系統,就有可能分開(kāi)。這是用3種不同極性展開(kāi)系統展開(kāi)所不能達到的。 2 對于一種溶劑系統,至少需要3種不同極性展開(kāi)系統展開(kāi),一種極性的展開(kāi)系統將目標組分的Rf推至0.5,另兩種極性的展開(kāi)系統將目標組分的Rf推至0.8,0.2。其作用是檢查有沒(méi)有極性比目標組分更大或更小的雜質(zhì)。 3 顯色方法,光展開(kāi)是不夠的,還要用各種顯色方法。一般一定要使用通用型顯色劑,如10%硫酸,碘,因為每種顯色劑(不論是通用型顯色劑,還是專(zhuān)屬顯色劑在工作中都遇到他們都有一化合物不顯色的時(shí)候),再根據組分可能含有混雜組份的情況,選用專(zhuān)屬顯色劑。只有在多個(gè)顯色劑下均為單一斑點(diǎn),這時(shí)才能下結論樣品為薄層純 二 通過(guò)熔程,判斷純度。原理很簡(jiǎn)單,純化合物,熔程很短,1~2度。混合物熔點(diǎn)下降,熔程變長(cháng)。 三,基于HPLC的純度鑒定,對于HPLC因為常用的系統較少,加之其分離效果好,我們一般不要求選擇三種分子間作用力不同的溶劑系統,只要求選這三種不同極性的溶劑系統,使目標峰在不同的保留時(shí)間出峰。 四,基于軟電離質(zhì)譜的純度鑒定。如ESI-MS,APCI-MS。大極性化合物選用ESI-MS,極性很小的化合物選用APCI-MS,這些軟電離質(zhì)譜的特點(diǎn)是只給出化合物的準分子離子峰,通過(guò)正負離子的相互溝通來(lái)確定分子量。如果樣品不純,就會(huì )檢出多對準分子離子峰,不但確定了純度,還能明確混雜物的分子量。 五,基于核磁共振的純度鑒定,從氫譜中如果發(fā)現有很多積分不到一的小峰,就有可能是樣品是樣品中的雜質(zhì)。利用門(mén)控去偶的技術(shù)通過(guò)對碳譜的定量也能實(shí)現純度鑒定。 這里只是對常見(jiàn)的純度鑒定方法做了一個(gè)小結,從快速,便宜,簡(jiǎn)便的要求出發(fā),以第一點(diǎn)最合要求,往后次之,所以對第一點(diǎn)詳加講述。當然每種方法多有各自的局限性,如基于氫譜的純度鑒定,如果發(fā)現有很多積分不到一的小峰,還有可能使樣品中的活潑質(zhì)子,基于軟電離質(zhì)譜的純度鑒定,如果混雜物的分子量與目標物一樣就無(wú)法 。
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